顆粒污泥中的磷酸酯酶的作用用于疾病診斷。磷酸酯酶屬于一種水解酶類，能夠催化酯化的磷酸基，就是把磷酸單酯化合物中磷酸單酯鍵切斷而讓磷酸基游離。磷酸酯酶還廣泛用于抗原抗體檢測反應，把AP包入免疫脂質(zhì)體，而酶底物在脂質(zhì)體外。當免疫脂質(zhì)體和抗原結合后，脂質(zhì)體膜通透性改變釋放出AP，AP和底物反應而顯色，此方法主要用于紅斑狼瘡、梅毒、乙型肝炎、單核白細胞增多癥等疾病的診斷。